RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 P01737 135 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 COX6A2Q02221 97 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 REG3GQ6UW15 175 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 C15orf56Q8N910 161 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 DERL1Q9BUN8 251 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ATP6V0CP27449 155 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 GTSF1Q8WW33 167 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 MBP02144 154 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 GZMBP10144 247 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 SERF2P84101 59 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 FAM74A7A6NL05 159 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 LTAP01374 205 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 IFNA7P01567 189 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF726P1Q15940 193 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 MAJINQ3KP22 176 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ENKURQ8TC29 256 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GUV1 79 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 SNAI2O43623 268 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 CXCL1P09341 107 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2G2P60604 165 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 STPG4Q8N801 248 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 FMC1Q96HJ9 113 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 A0A096LNI7 61 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 RAB5CP51148 216 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-209ENST00000526080 OR5AL1P0C617 328 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2G1P62253 170 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 AQP10Q96PS8 301 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 F5H697 171 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 M0QY20 66 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 SSNA1O43805 119 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 IFITM3Q01628 133 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 CFAP161Q6P656 301 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZRP5 223 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM243Q9BU79 118 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 UPK1BO75841 260 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 AP1S3Q96PC3 154 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 A6NHS1 94 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 FHITP49789 147 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 MLST8Q9BVC4 326 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 DEFA3P59666 94 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRU-209ENST00000526080 H7C1H1 209 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM17P0DL12 118 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 SULT1A2P50226 295 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 S100ZQ8WXG8 99 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 AKR1C3P42330 323 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 MED28Q9H204 178 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 MUC17Q685J3 4493 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 FAM231BA6NCW3 169 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 SSTP61278 116 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 MGPP08493 103 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 FOXI1Q12951 378 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2L6O14933 153 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 IGLC6P0CF74 106 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 RASL11AQ6T310 242 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 STOML3Q8TAV4 291 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.42□□□□□ -1.06
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