RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa2.84□□□□□ -1.95
HDAC2-216ENST00000523628 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.84□□□□□ -1.95
HDAC2-216ENST00000523628 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.84□□□□□ -1.95
HDAC2-216ENST00000523628 MED28Q9H204 178 aa2.84□□□□□ -1.95
HDAC2-216ENST00000523628 IL36BQ9NZH7 164 aa2.84□□□□□ -1.95
HDAC2-216ENST00000523628 KMT2AQ03164 3969 aa2.84□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa2.83□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 H7C1H1 209 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 M0R3E3 92 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 PFDN1O60925 122 aa2.83□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 ASIPP42127 132 aa2.83□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 LINC00315P59091 139 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF345Q14585 488 aa2.83□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM183AQ8IXX5 376 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP82Q8N141 532 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.83□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 RNF222A6NCQ9 220 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 IFNA7P01567 189 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ARL14EPLP0DKL9 152 aa2.82□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 H2BFSP57053 126 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DSCR10P59022 87 aa2.82□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 SMAGPQ0VAQ4 97 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 OR10J3Q5JRS4 329 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 FAM162BQ5T6X4 162 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ATRAIDQ6UW56 229 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N976 141 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 EPDR1Q9UM22 224 aa2.82□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.81□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 RS1O15537 224 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 GCGP01275 180 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 IFNA1P01562 189 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM17P0DL12 118 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 GCHFRP30047 84 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB1P60022 68 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SSTP61278 116 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ERCC8Q13216 396 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TEX261Q6UWH6 196 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 HYLS1Q96M11 299 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf85Q96MD7 179 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 MANBALQ9NQG1 85 aa2.81□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 PSG8Q9UQ74 426 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.81□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 RBFOX3A6NFN3 312 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 HMSDA8MTL9 139 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 B4DEV8 164 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 F2Z2F3 143 aa2.8□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-53P01767 116 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 CRPP02741 224 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TYMSP04818 313 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V0CP27449 155 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 RAB4BP61018 213 aa2.8□□□□□ -1.96
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HDAC2-216ENST00000523628 RGS21Q2M5E4 152 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N814 137 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 Q8TAT8 98 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.8□□□□□ -1.96
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