RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 NDUFS8O00217 210 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 BRI3O95415 125 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 COX6B1P14854 86 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 UBE2D1P51668 147 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ERCC8Q13216 396 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 HES1Q14469 280 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 C12orf74Q32Q52 190 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 OR11H1Q8NG94 326 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 OR11H2Q8NH07 326 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 RAB37Q96AX2 223 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TOMM6Q96B49 74 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 C16orf74Q96GX8 76 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 METTL26Q96S19 204 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 S4R3C0 116 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 J3QR89 54 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 K7ENP7 123 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 GOSR1O95249 250 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R17O96001 155 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-23P01764 117 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 UBE2E1P51965 193 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 UBE2D3P61077 147 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 UBE2D2P62837 147 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 PRR9Q5T870 116 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SAMD13Q5VXD3 122 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 BAALCQ8WXS3 180 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LINC00477Q96M19 166 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 FRYLO94915 3013 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CUL9Q8IWT3 2517 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 BSNQ9UPA5 3926 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 H3BMG7 143 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 H3BUA1 57 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 H3BVH4 76 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 M0QXV9 152 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 OVOL1O14753 267 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ASIPP42127 132 aa2.87□□□□□ -1.95
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SGCE-211ENST00000522045 TCTAP57738 103 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 GPHB5Q86YW7 130 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 RNF182Q8N6D2 247 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 C5orf56Q8N8D9 126 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LINC01560Q8TB33 94 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TIMM17AQ99595 171 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 PLXNB1O43157 2135 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GV72 72 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 C11orf86A6NJI1 115 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 NDUFA4O00483 81 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CD7P09564 240 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SAA4P35542 130 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 NBL1P41271 181 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LINC00315P59091 139 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 WFDC2Q14508 124 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TMEM141Q96I45 108 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LINC01600Q96MT4 127 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ODF3Q96PU9 254 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H4GQ99525 98 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SIGMAR1Q99720 223 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1HO95180 2353 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.85□□□□□ -1.95
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