RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TEX22C9J3V5 150 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS9O00182 355 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 HILS1P60008 231 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01620Q4KN68 170 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 A0A096LNT2 108 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-33P01772 117 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SPXQ9BT56 116 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PRX2 142 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf86A6NJI1 115 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 H3BMM0 161 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2WQ96B02 151 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TOMM6Q96B49 74 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 PRAC2D3DTV9 90 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 CRYGDP07320 174 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 K7EIM0 57 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 HERVK_113P63121 156 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA7O95182 113 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 RBAKDNA6NC62 111 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 M0R2P5 195 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 Q1RN00 199 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 BLCAPP62952 87 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 A6NDX4 124 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 PDE6HQ13956 83 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 ATXN8Q156A1 80 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 AMELXQ99217 191 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 PMVKQ15126 192 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf82Q6UX34 121 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 RNF182Q8N6D2 247 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM101Q96IK0 257 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TENM4Q6N022 2769 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TRIAP1O43715 76 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 HERVK_113P61574 105 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 H7C423 109 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TSHBP01222 138 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 EBI3Q14213 229 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 CRYGBP07316 175 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 APCP25054 2843 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-11P01762 117 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-23P01764 117 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 P0DMU3 169 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 FAM231AP0DMU4 169 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 FAM231CP0DMU5 169 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V0E1O15342 81 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 LY6LH3BQJ8 138 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZSV7 163 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 J3KT08 172 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N9W7 124 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 G3V318 75 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC2BQ92478 149 aa7.55□□□□□ -1.2
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