RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513499.5

CCNH-210, Transcript of cyclin H, human

TSL 3

Gene CCNH, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-210	ENST00000513499	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	PTTG1	O95997	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	IL7	P13232	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	RBX1	P62877	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	NRAC	Q8N912	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNH-210	ENST00000513499	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SIX6	O95475	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	CRIP1	P50238	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	RAB2A	P61019	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		A0A1W2PPV4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		B4DEV8	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		M0R036	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		M0R381	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	LYRM1	O43325	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	COX6A2	Q02221	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	GAGE6	Q13070	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		K7EQM0	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	RAB5C	P51148	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	REG3A	Q06141	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	STPG4	Q8N801	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	GCHFR	P30047	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	PKIA	P61925	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		H7C1H1	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	SH2D1A	O60880	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	RAB4B	P61018	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		A0A096LNI7	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499		P01737	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	ZNF56	Q15929	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-210	ENST00000513499	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	H2BFS	P57053	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499		Q6ZRP5	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499		Q86TA4	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	MPC2	O95563	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	GZMB	P10144	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-210	ENST00000513499	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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