RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NDX4 124 aa9.65□□□□□ -0.86
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RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
RABGEF1-211ENST00000503687 C9JAW5 83 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGEF1-211ENST00000503687 A8MWV9 139 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGEF1-211ENST00000503687 I3L3M4 83 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF415Q09FC8 603 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGEF1-211ENST00000503687 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-211ENST00000503687 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.63□□□□□ -0.87
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RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.54□□□□□ -0.88
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RABGEF1-211ENST00000503687 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-211ENST00000503687 TM2D2Q9BX73 214 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-211ENST00000503687 G3V4G9 280 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMB8P28062 276 aa9.51□□□□□ -0.89
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