RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PKHD1	P08F94	4074 aa		-0	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		-0	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TNXB	P22105	4242 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PBRM1	Q86U86	1689 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	LRP5	O75197	1615 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	ATM	Q13315	3056 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	SMIM24	O75264	130 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	MT-ND4L	P03901	98 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	S100A5	P33763	92 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	COX6A2	Q02221	97 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DDA1	Q9BW61	102 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	BANF2	Q9H503	90 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIO	O75962	3097 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	FRYL	O94915	3013 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PLXNA2	O75051	1894 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	HSPG2	P98160	4391 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	HTT	P42858	3142 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	LPA	P08519	4548 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1B0GW64	132 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	RBAKDN	A6NC62	111 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	RBP4	P02753	201 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CMPK1	P30085	196 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	HSPB11	Q9Y547	144 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	LAMA1	P25391	3075 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	MGA	Q8IWI9	3026 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	LAMA3	Q16787	3333 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	ZZEF1	O43149	2961 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	ZFHX3	Q15911	3703 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TSC2	P49815	1807 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	MUC17	Q685J3	4493 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615		M0R2T5	61 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	EMX2	Q04743	252 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	GINS2	Q9Y248	185 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	EYS	Q5T1H1	3165 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PKD1	P98161	4303 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	AKAP9	Q99996	3911 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	DMD	P11532	3685 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		-0.03	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SOGA1	O94964	1423 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DEGS1	O15121	323 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	YPEL1	O60688	119 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TNF	P01375	233 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	APOD	P05090	189 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC25A6	P12236	298 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	COX4I1	P13073	169 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	HLA-DRB4	P13762	266 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	OR8B8	Q15620	311 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CLLU1	Q5K131	121 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	LELP1	Q5T871	98 aa		-0.04	□□□□□ -2.42

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