RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 SMIM17P0DL12 118 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 P0DMU3 169 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 FAM231AP0DMU4 169 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 FAM231CP0DMU5 169 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 FHL2Q14192 279 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 A0A096LNJ9 63 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 LYRM9A8MSI8 78 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 BAGE3Q86Y29 109 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC22C-216ENST00000493107 C20orf78Q9BR46 151 aa6.65□□□□□ -1.34
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SEC22C-216ENST00000493107 RHODO00212 210 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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SEC22C-216ENST00000493107 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 Q8N8P6 123 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 NIT2Q9NQR4 276 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.64□□□□□ -1.35
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SEC22C-216ENST00000493107 DEFB130AP0DP74 79 aa6.63□□□□□ -1.35
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SEC22C-216ENST00000493107 C12orf74Q32Q52 190 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.63□□□□□ -1.35
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SEC22C-216ENST00000493107 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TCAPO15273 167 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 CIDEAO60543 219 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 LINC00694P0DN24 101 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 MRAPQ8TCY5 172 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 K7EQD1 137 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 PPP1R17O96001 155 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 FABP4P15090 132 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 ST20Q9HBF5 79 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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SEC22C-216ENST00000493107 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 NOTCH1P46531 2555 aa6.61□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 A0A0J9YWU9 116 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 VCYO14598 125 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 HSBP1O75506 76 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 TSHBP01222 138 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 CRYBA4P53673 196 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 FA2HQ7L5A8 372 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 SPATA25Q9BR10 227 aa6.6□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 H7C1H1 209 aa6.59□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 PMCHP20382 165 aa6.59□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 AMTP48728 403 aa6.59□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 UBE2D3P61077 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 UBE2D2P62837 147 aa6.59□□□□□ -1.35
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SEC22C-216ENST00000493107 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.59□□□□□ -1.35
SEC22C-216ENST00000493107 NACAE9PAV3 2078 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 GAGE12JA6NER3 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 I3L3M4 83 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 FCER1GP30273 86 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 DAD1P61803 113 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 GAGE1Q13065 139 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 GAGE4Q13068 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 GAGE5Q13069 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 LAGE3Q14657 143 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 GAGE13Q4V321 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 Q8N976 141 aa6.58□□□□□ -1.36
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM18Q96B42 140 aa6.58□□□□□ -1.36
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