RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00315	P59091	139 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717		U3KQK5	164 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1B0GUT8	65 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1B0GW15	77 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	GNRH2	O43555	120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	ORM1	P02763	201 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	MT-ND6	P03923	174 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	S100P	P25815	95 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	TCL1A	P56279	114 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	FXYD7	P58549	80 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	HBB	P68871	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	COX19	Q49B96	90 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	LYST	Q99698	3801 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717		H3BVH4	76 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	AZU1	P20160	251 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	NTF3	P20783	257 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	ASIP	P42127	132 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	SLA	Q13239	276 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DCTN1-222	ENST00000492717	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.03	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	SPINK4	O60575	86 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	TRGC2	P03986	189 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	PRM2	P04554	102 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	CRYGD	P07320	174 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	CACNG7	P62955	275 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717		Q8NAQ8	132 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	RASL10A	Q92737	203 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	FRZB	Q92765	325 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	APOC4	P55056	127 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.01	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717		M0R2P5	195 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	S100A8	P05109	93 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	TRGC1	P0CF51	173 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	ESD	P10768	282 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB4A	P20338	218 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	EVI2A	P22794	236 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6ZRP5	223 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	AMN1	Q8IY45	258 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	JPT2	Q9H910	190 aa		4	□□□□□ -1.77
DCTN1-222	ENST00000492717	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms