RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489756.1

DTNB-223, Transcript of dystrobrevin beta, human

TSL 4

Gene DTNB, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DTNB-223	ENST00000489756	PRB1	P04280	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	EMP1	P54849	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DEFB131A	P59861	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		Q5PR19	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		Q8N2B8	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TACC2	O95359	2948 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		A0A0J9YY99	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		A8MWV9	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		G3V4G9	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		H3BMM0	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	LEPROT	O15243	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		P0DMU3	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		J3QQQ9	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		M0R2P5	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	CD28	P10747	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	HTN1	P15515	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	UBE2D1	P51668	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	COTL1	Q14019	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	PTH2	Q96A98	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		Q96MF0	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	MUC4	Q99102	2169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756		F8W1H4	67 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	RHOD	O00212	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TSPAN13	O95857	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	INS	P01308	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	AMELX	Q99217	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	VCX2	Q9H322	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DTNB-223	ENST00000489756	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64	8e-6	■■□□□ 12.9
DTNB-223	ENST00000489756		A0A0J9YXV3	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756		H3BMG7	143 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	PROK1	P58294	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	WFDC2	Q14508	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	LINC01587	Q99440	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756		J3QR89	54 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DTNB-223	ENST00000489756	RS1	O15537	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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