RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 DEFB130AP0DP74 79 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF415Q09FC8 603 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 NIT1Q86X76 327 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 NACAE9PAV3 2078 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 TSTD3H0UI37 97 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 ATP5G1P05496 136 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 CKS2P33552 79 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 FA2HQ7L5A8 372 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PTH2Q96A98 100 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PRELID3AQ96N28 172 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 Q6ZTI0 123 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 RASL10AQ92737 203 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 SPXQ9BT56 116 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 JPT2Q9H910 190 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 C20orf202A1L168 122 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 F5H768 121 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 M0R2P5 195 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 NUPR1O60356 82 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PKIAP61925 76 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PMCHL1Q16048 86 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 SYT8Q8NBV8 401 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 MRAP2Q96G30 205 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP4-208ENST00000489554 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 M0R381 172 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00310P59036 64 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00315P59091 139 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF876PQ49A33 203 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 AMN1Q8IY45 258 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 D6R8Y8 96 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 K7EMI3 77 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LEPROTL1O95214 131 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 CRYGDP07320 174 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 SMIM17P0DL12 118 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 G0S2P27469 103 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 SSTP61278 116 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 C18orf15Q96N68 181 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 AP1S3Q96PC3 154 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE12BA1L429 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC01549A6NIU2 74 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 PRSS47A8MTI9 375 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 RS1O15537 224 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE7O76087 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE12FP0CL80 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE12GP0CL81 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE12IP0CL82 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 KRTDAPP60985 99 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 M0R2N4 97 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 NUDT3O95989 172 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 EVI2AP22794 236 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 RNF185Q96GF1 192 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A087WWL8 130 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 CCL18P55774 89 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 PET117Q6UWS5 81 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 Q6ZR54 194 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 Q6ZSN1 163 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF479Q96JC4 524 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 C20orf78Q9BR46 151 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 VAMP8Q9BV40 100 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC01546A6NGU7 62 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 A8MWV9 139 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 H3BNG1 76 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 TNFRSF6BO95407 300 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 C3orf79P0CE67 100 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP4-208ENST00000489554 Q8N8P6 123 aa7.34□□□□□ -1.23
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