RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 RNF185Q96GF1 192 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 M0QY20 66 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 PAX4O43316 350 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 HOXA5P20719 270 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 CKS2P33552 79 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TCTAP57738 103 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 ORMDL3Q8N138 153 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 NIT2Q9NQR4 276 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NUPR2A6NF83 97 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 C20orf78Q9BR46 151 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 HTN3P15516 51 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 PRSS47A8MTI9 375 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 D6R8Y8 96 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TCAPO15273 167 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZSN1 163 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 PRELID3AQ96N28 172 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 ST20Q9HBF5 79 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF6BO95407 300 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 GYPEP15421 78 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NRACQ8N912 160 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 KMT2AQ03164 3969 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 K7EMI3 77 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 VCYO14598 125 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 LY6G6CO95867 125 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TRGC2P03986 189 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 LINC00694P0DN24 101 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 SRIP30626 198 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TIRAPP58753 221 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YY99 117 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NCR2O95944 276 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 PMCHP20382 165 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 UBE2D3P61077 147 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 UBE2D2P62837 147 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
NISCH-211ENST00000488243 NACAE9PAV3 2078 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 A0A096LPF7 62 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 GAGE12JA6NER3 117 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 IGLL5B9A064 214 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 SMKR1H3BMG3 65 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 I3L3M4 83 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 NPYP01303 97 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 RAB5BP61020 215 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 GAGE1Q13065 139 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 GAGE4Q13068 117 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 GAGE5Q13069 117 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 GAGE13Q4V321 117 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DL4Q99706 377 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 P0DMU3 169 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 FAM231AP0DMU4 169 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 FAM231CP0DMU5 169 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 G0S2P27469 103 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-211ENST00000488243 LINC01549A6NIU2 74 aa8.12□□□□□ -1.11
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