RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 KLK9Q2XQG4 91 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 CHD6Q8TD26 2715 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 DDTP30046 118 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 TDRG1Q3Y452 100 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF815PA8K554 130 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GXF2 115 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 SOCS3O14543 225 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 FHL3Q13643 280 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 JPT2Q9H910 190 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 PRR9Q5T870 116 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 NACAE9PAV3 2078 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZWC4 215 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 GATD1Q8NB37 220 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 F8VRH5 84 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 H7C2G1 150 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00158P58513 81 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 HERVK_113P63121 156 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM238C9JI98 176 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 CITED1Q99966 193 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZQT7 251 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF479Q96JC4 524 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 IGLL5B9A064 214 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 CTAG1AP78358 180 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 AMTNQ6UX39 209 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 hDV102S1A0JD36 115 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2WQ96B02 151 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RS1O15537 224 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf85Q96MD7 179 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 PYY3Q5JQD4 70 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0U1RRA0 63 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 FGF6P10767 208 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 J3QR89 54 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM13P0DJ93 91 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 FRYLO94915 3013 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 EREGO14944 169 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 STPG4Q8N801 248 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 TIMM17AQ99595 171 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-211ENST00000486161 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.05□□□□□ -1.44
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