RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RS1O15537 224 aa12.69□□□□□ -0.38
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAND5Q8N907 189 aa12.68□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAMPP81172 84 aa12.68□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRAPQ8TCY5 172 aa12.67□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRORYQ9H606 182 aa12.67□□□□□ -0.38
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EML5Q05BV3 1969 aa12.67□□□□□ -0.38
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIFOQ8TCI5 191 aa12.65□□□□□ -0.38
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC2Q14508 124 aa12.62□□□□□ -0.39
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMM17AQ99595 171 aa12.55□□□□□ -0.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.54□□□□□ -0.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS47A8MTI9 375 aa12.54□□□□□ -0.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-33P01772 117 aa12.54□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.54□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.54□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf173Q96LM9 149 aa12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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