RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1R17O96001 155 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TSHBP01222 138 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 P0DMU3 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 FAM231AP0DMU4 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 FAM231CP0DMU5 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 EMP1P54849 157 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 LINC01006Q8NI28 216 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 H7C1H1 209 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 K7ERJ3 54 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 Q9UF83 564 aa6.5□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 F8VRH5 84 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 K7ERU9 68 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 VCYO14598 125 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 GAGE10A6NGK3 116 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 A8MTW9 85 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 SAP30O75446 220 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 KIR2DL4Q99706 377 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 XCL2Q9UBD3 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 H3BUT2 72 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 FHL3Q13643 280 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 LINC01587Q99440 93 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 C9orf118A6NHY6 69 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 IGIPA6NJ69 53 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 H3BRM9 83 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 PLNP26678 52 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 Q6ZSN1 163 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TEX29Q8N6K0 151 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.48□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 A6NDN8 102 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 SIVA1O15304 175 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 FXYD2P54710 66 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 HSD52Q0P140 79 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 NACAE9PAV3 2078 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 AZU1P20160 251 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 JMJD1CQ15652 2540 aa6.47□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 GCSHP23434 173 aa6.46□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CDHR3-211ENST00000478080 K7EP34 96 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 C11orf86A6NJI1 115 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 M0R2P5 195 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.46□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 RIPPLY3P57055 190 aa6.45□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 STHQ8IWL8 128 aa6.45□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 INSP01308 110 aa6.45□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF415Q09FC8 603 aa6.45□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.45□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 MTURNQ8N3F0 131 aa6.45□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 NOTCH2Q04721 2471 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 OR11H12B2RN74 326 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 I3L3M4 83 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 PMVKQ15126 192 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 C16orf95Q9H693 158 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 OR11H2Q8NH07 326 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 HIGD1BQ9P298 99 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 HIVEP2P31629 2446 aa6.44□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PPM0 123 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 HILS1P60008 231 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 TIMM17AQ99595 171 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 A8MWV9 139 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 E9PLD3 99 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 G3V4G9 280 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 KRTAP10-3P60369 221 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM141Q96I45 108 aa6.43□□□□□ -1.38
CDHR3-211ENST00000478080 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.43□□□□□ -1.38
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