RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-1.66□□□□□ -2.68
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SHQ1-204ENST00000468347 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 MRC1P22897 1456 aa-1.67□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 NCAPD3P42695 1498 aa-1.67□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-1.67□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-1.67□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-1.67□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-1.67□□□□□ -2.68
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SHQ1-204ENST00000468347 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-1.68□□□□□ -2.68
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SHQ1-204ENST00000468347 UBE2D1P51668 147 aa-1.68□□□□□ -2.68
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SHQ1-204ENST00000468347 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-1.7□□□□□ -2.68
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SHQ1-204ENST00000468347 CRYGSP22914 178 aa-1.71□□□□□ -2.68
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SHQ1-204ENST00000468347 BRK1Q8WUW1 75 aa-1.71□□□□□ -2.68
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