RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454269.5

HCG18-240, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 2,430 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-240ENST00000454269 IGKV1D-12P01611 117 aa6.52□□□□□ -1.36
HCG18-240ENST00000454269 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
HCG18-240ENST00000454269 Q6ZS46 218 aa6.52□□□□□ -1.36
HCG18-240ENST00000454269 LCA10Q71F78 164 aa6.52□□□□□ -1.36
HCG18-240ENST00000454269 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 E7EQL1 145 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 F6UB75 175 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 ZNF876PQ49A33 203 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 FAM229AH3BQW9 127 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 PRB1P04280 392 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 MORN5Q5VZ52 161 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 PRR25Q96S07 402 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 U3KQA8 63 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 CCL17Q92583 94 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 BLCAPP62952 87 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 LAGE3Q14657 143 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 SPINK9Q5DT21 86 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 Q86TA4 180 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 CLEC2BQ92478 149 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 FLNCQ14315 2725 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGKV3-11P04433 115 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 AMELXQ99217 191 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 SDK2Q58EX2 2172 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 F8W735 103 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 M0R381 172 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 MIFP14174 115 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 NBASA2RRP1 2371 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 COX7A2P2O60397 106 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 DNAL4O96015 105 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 UBALD1Q8TB05 177 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 TOMM6Q96B49 74 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 RMI2Q96E14 147 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-240ENST00000454269 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 I3L3M4 83 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 DIRC1Q969H9 104 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 LCE2BO14633 110 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 Q0VFX4 171 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 RNF185Q96GF1 192 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 A0A087WZ39 114 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 ZNF575Q86XF7 245 aa6.45□□□□□ -1.38
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HCG18-240ENST00000454269 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.45□□□□□ -1.38
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HCG18-240ENST00000454269 SH2D1AO60880 128 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 A6NN06 94 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 C17orf98A8MV24 154 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 LINC00205P59089 165 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 LINC00846Q9NV44 126 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 C22orf24Q9Y442 160 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 CACNA1DQ01668 2161 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 SPTA1P02549 2419 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 M0R3E3 92 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-240ENST00000454269 TRBV12-3P01733 135 aa6.43□□□□□ -1.38
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