RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 NRACQ8N912 160 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 P0DMU3 169 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 FAM231AP0DMU4 169 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 FAM231CP0DMU5 169 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 PMCHP20382 165 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 FHL2Q14192 279 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 RHOHQ15669 191 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZSN1 163 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 C20orf78Q9BR46 151 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 C12orf74Q32Q52 190 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 NIT1Q86X76 327 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CITED1-206ENST00000431381 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 GAGE12JA6NER3 117 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 PAX4O43316 350 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 HSBP1O75506 76 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 SERF1AO75920 110 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 LINC00614P0C842 121 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 GAGE1Q13065 139 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 GAGE4Q13068 117 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 GAGE5Q13069 117 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 GAGE13Q4V321 117 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 KIR2DL4Q99706 377 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 PRO0255Q9UI72 69 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 VCYO14598 125 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 HOXA5P20719 270 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 S100A2P29034 98 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 Q8N8P6 123 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 A0A0J9YY99 117 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 FCER1GP30273 86 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 CRYBA4P53673 196 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZTC4 211 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 PRSS47A8MTI9 375 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 I3L3M4 83 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TCAPO15273 167 aa9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 GYPEP15421 78 aa9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.23□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 C5orf52A6NGY3 159 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 AMTP48728 403 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 LAGE3Q14657 143 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 Q9UF83 564 aa9.22□□□□□ -0.93
CITED1-206ENST00000431381 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 K7EMI3 77 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 NUPR1O60356 82 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 NUDT3O95989 172 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 COTL1Q14019 142 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 PMCHL1Q16048 86 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 TMEM18Q96B42 140 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.21□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.2□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 G0S2P27469 103 aa9.2□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 UBE2D3P61077 147 aa9.2□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 UBE2D2P62837 147 aa9.2□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.2□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.2□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 A0A096LPF7 62 aa9.19□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.19□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 HBDP02042 147 aa9.19□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 ESDP10768 282 aa9.19□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 LINC00310P59036 64 aa9.19□□□□□ -0.94
CITED1-206ENST00000431381 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms