RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.12□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 TEX22C9J3V5 150 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 MP68P56378 58 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF843Q8N446 348 aa11.12□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 H3BT86 120 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 C19orf84I3L1E1 186 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA25Q9BR10 227 aa11.11□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 TIMM17AQ99595 171 aa11.11□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.1□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.1□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 UTRNP46939 3433 aa11.09□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 Q8N9W7 124 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 MDFICQ9P1T7 246 aa11.08□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 PIFOQ8TCI5 191 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 ALPK3Q96L96 1907 aa11.07□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.06□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.05□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 C16orf74Q96GX8 76 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRSQ13332 1948 aa11.05□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 TMEM131Q92545 1883 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.05□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 A0A087WW49 117 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 RBX1P62877 108 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 P0DMU3 169 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 FAM231AP0DMU4 169 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 MSMPQ1L6U9 139 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZPA2 131 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 TRBV12-3P01733 135 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0J9YXY3 114 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 IGLC6P0CF74 106 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRU-204ENST00000428026 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 MIAQ16674 131 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 C20orf197Q8N268 126 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 NCKAP5O14513 1909 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV1-47P01700 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-204ENST00000428026 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.01□□□□□ -0.65
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