RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399899.1

CLDN8-201, Transcript of claudin 8, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN8, Length 2,068 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8-201ENST00000399899 C9orf85Q96MD7 179 aa6.43□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 HIST1H4GQ99525 98 aa6.43□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 ESM1Q9NQ30 184 aa6.43□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 K7ERJ3 54 aa6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 CRYGDP07320 174 aa6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 CD7P09564 240 aa6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.42□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 SAP30O75446 220 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 TSHBP01222 138 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 TIMM17AQ99595 171 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 KIR2DL4Q99706 377 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 JPT2Q9H910 190 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 AGRNO00468 2067 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 PMVKQ15126 192 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 SYT8Q8NBV8 401 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.4□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF688P0C7X2 276 aa6.4□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.4□□□□□ -1.38
CLDN8-201ENST00000399899 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 A0A087WWL8 130 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 F5H697 171 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ELANEP08246 267 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 RRN3P1Q2M238 152 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF479Q96JC4 524 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 MDFICQ9P1T7 246 aa6.4□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 CUBNO60494 3623 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 C11orf86A6NJI1 115 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF815PA8K554 130 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 F8W1H4 67 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 M0QY20 66 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 HERVK_113P61574 105 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 RHOHQ15669 191 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ATRQ13535 2644 aa6.39□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF876PQ49A33 203 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 Q8N1Y9 231 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 NDUFA7O95182 113 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SYNJ2BPP57105 145 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 AMTNQ6UX39 209 aa6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 UBE2D1P51668 147 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 A8MTW9 85 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 IGKV3-20P01619 116 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 COTL1Q14019 142 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 NFE4Q86UQ8 179 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 C16orf95Q9H693 158 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF702PQ9H963 129 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 A0A0J9YY99 117 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 P0DMU3 169 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 FAM231AP0DMU4 169 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 FAM231CP0DMU5 169 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNF56Q15929 161 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 MDFIQ99750 246 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 I3L3M4 83 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 Q8N2B8 174 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 WFDC2Q14508 124 aa6.35□□□□□ -1.39
CLDN8-201ENST00000399899 GAGE13Q4V321 117 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms