RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 Q9UF83 564 aa8.7□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 A0A096LPF7 62 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 RAB4AP20338 218 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 RHOHQ15669 191 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GATD1Q8NB37 220 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.69□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 H3BNG1 76 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 K7EQD1 137 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GYPEP15421 78 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 ESRGQ1W209 222 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 RASL11AQ6T310 242 aa8.68□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 M0QY20 66 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 M0R2N4 97 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 SCO1O75880 301 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 YPEL4Q96NS1 127 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.67□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.66□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 H7C1H1 209 aa8.66□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.66□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GAGE12JA6NER3 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GAS8-AS1O95177 125 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 CCL18P55774 89 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GAGE1Q13065 139 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GAGE4Q13068 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GAGE5Q13069 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 GAGE13Q4V321 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 MRAP2Q96G30 205 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.65□□□□□ -1.02
CNMD-201ENST00000377962 SMKR1H3BMG3 65 aa8.64□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 COX19Q49B96 90 aa8.64□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 FRZBQ92765 325 aa8.64□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.64□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 NIT2Q9NQR4 276 aa8.64□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 NCR2O95944 276 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 SRIP30626 198 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 CKS2P33552 79 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 HLA-DQA1P01909 254 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 APCSP02743 223 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.63□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 COLCA2A8K830 154 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 D6R8Y8 96 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 LINC00694P0DN24 101 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 UBE2D3P61077 147 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 UBE2D2P62837 147 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 KMT2AQ03164 3969 aa8.62□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 PPBPP02775 128 aa8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 MT-ND6P03923 174 aa8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 ORMDL3Q8N138 153 aa8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 NRACQ8N912 160 aa8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.61□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.6□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R17O96001 155 aa8.6□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 Q6ZR54 194 aa8.6□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 Q9H8V8 135 aa8.6□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 ST20Q9HBF5 79 aa8.6□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.59□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 TNFRSF6BO95407 300 aa8.59□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 PRELID3AQ96N28 172 aa8.59□□□□□ -1.03
CNMD-201ENST00000377962 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 NPYP01303 97 aa8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.57□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 PHOX2AO14813 284 aa8.57□□□□□ -1.04
CNMD-201ENST00000377962 RAB5AP20339 215 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms