RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 I3L3M4 83 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLL1P15814 213 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 AZU1P20160 251 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 RRN3P1Q2M238 152 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 hDV102S1A0JD36 115 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRM2P04554 102 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAJINQ3KP22 176 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 C14orf144Q96I85 54 aa9.43□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 CIDEAO60543 219 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPM2O94777 84 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 ODF1Q14990 250 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERASQ7Z444 233 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM141Q96I45 108 aa9.42□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A087WX48 190 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-53P01767 116 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKCP01834 107 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.41□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 NACAE9PAV3 2078 aa9.4□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 M0R143 59 aa9.4□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLNP26678 52 aa9.4□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.4□□□□□ -0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.4□□□□□ -0.913e-9■■□□□ 14
NME1-NME2-201ENST00000376392 APOC4P55056 127 aa9.39□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 TIMM17AQ99595 171 aa9.39□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZMAT4Q9H898 229 aa9.39□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 DKK2Q9UBU2 259 aa9.39□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 F8VRH5 84 aa9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 WIPF1O43516 503 aa9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSHBP01222 138 aa9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 FBN3Q75N90 2809 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 COX8AP10176 69 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q6ZTI0 123 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 C3orf56Q8N813 242 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 BAALCQ8WXS3 180 aa9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 K7EQD1 137 aa9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTAG1AP78358 180 aa9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGIPA6NJ69 53 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 P0DMU3 169 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM231AP0DMU4 169 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM231CP0DMU5 169 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 COTL1Q14019 142 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 PMVKQ15126 192 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF479Q96JC4 524 aa9.35□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE12BA1L429 117 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE7O76087 117 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE12FP0CL80 117 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE12GP0CL81 117 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE12IP0CL82 117 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q6ZSN1 163 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 STPG4Q8N801 248 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.34□□□□□ -0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 EREGO14944 169 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DLEU1O43261 78 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPSP0C0P6 89 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 NMUP48645 174 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms