RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PRELID3AQ96N28 172 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 VCYO14598 125 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 Q86TA4 180 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CELA1Q9UNI1 258 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM250H0YL14 139 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 HERVK_113P61574 105 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 Q6AWC8 147 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C18orf15Q96N68 181 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 H3BRM9 83 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TYMSP04818 313 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE2EQ4V326 116 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf38Q86SI9 138 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ISOC2Q96AB3 205 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 Q0VG73 95 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV2-11P01706 119 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 MAJINQ3KP22 176 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 BAALCQ8WXS3 180 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT11Q96G61 164 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00158P58513 81 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 HBBP68871 147 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ORMDL3Q8N138 153 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 OCC1Q8TAD7 63 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 JPT2Q9H910 190 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CIDEAO60543 219 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ADCYAP1P18509 176 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 KLK9Q2XQG4 91 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NIT2Q9NQR4 276 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 RBAKDNA6NC62 111 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 IGLC2P0DOY2 106 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TIRAPP58753 221 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ODF1Q14990 250 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WZ39 114 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf85Q96MD7 179 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA5P20719 270 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 Q1RN00 199 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N976 141 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC16Q96DE5 110 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087X0K7 114 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SMKR1H3BMG3 65 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 I3L3M4 83 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM6P0DI80 62 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms