RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ZNF688P0C7X2 276 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 LINC01587Q99440 93 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 KCNS1Q96KK3 526 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 NOTCH2Q04721 2471 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 KMT2AQ03164 3969 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 RBAKDNA6NC62 111 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 C2orf70A6NJV1 201 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 FHL3Q13643 280 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 CENPWQ5EE01 88 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZQT7 251 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 C16orf92Q96LL3 132 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 RNF182Q8N6D2 247 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 NF1P21359 2839 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 F6UB75 175 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 M0R3E3 92 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 UQCRQO14949 82 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 OVOL1O14753 267 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 CD7P09564 240 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.54□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 IGLV2-11P01706 119 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 IGLV2-8P01709 118 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
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CCR6-201ENST00000341935 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 Q86TA4 180 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 MTORP42345 2549 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 NMUP48645 174 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 PRNTQ86SH4 94 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 USP17L23D6RBM5 183 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 APOC4P55056 127 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 DPH3Q96FX2 82 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 MDFICQ9P1T7 246 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 PRAC2D3DTV9 90 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 OXTP01178 125 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 ZNF56Q15929 161 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 Q8N976 141 aa4.53□□□□□ -1.68
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