RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308641.5

APOBEC4-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC4, Length 2,650 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4-201ENST00000308641 GPHB5Q86YW7 130 aa6.06□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 ZNF292O60281 2723 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 RNF7Q9UBF6 113 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 TIMM17BO60830 172 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 IGHV1-69P01742 117 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 ZNF580Q9UK33 172 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 TEX22C9J3V5 150 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 KLKP1Q107X0 134 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 PRR15Q8IV56 129 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 Q8N2B8 174 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 PRSS33Q8NF86 280 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 Q9UF83 564 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 PRAC2D3DTV9 90 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 NXPH4O95158 308 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 TRBV12-3P01733 135 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 MGPP08493 103 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 HILS1P60008 231 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 CFHR3Q02985 330 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 Q6ZRU5 148 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 ABCA1O95477 2261 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 PINLYPA6NC86 204 aa6.02□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 K7EIM0 57 aa6.02□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 MSMPQ1L6U9 139 aa6.02□□□□□ -1.44
APOBEC4-201ENST00000308641 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 POLEQ07864 2286 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 VCYO14598 125 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 BCE1O60756 84 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 U3KQE9 123 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 A0A087WW49 117 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 A0A0J9YXV3 536 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 Q6ZS52 159 aa6.02□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 F5P12259 2224 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 H3BS24 57 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 PAX4O43316 350 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 SPRY3O43610 288 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 FOLR3P41439 243 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 F8WEM9 126 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 GAFA1Q96PS6 74 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 SAA4P35542 130 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 TMEM105Q8N8V8 129 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 FAM186AA6NE01 2351 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 NDPQ00604 133 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 CACNA1AO00555 2505 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 NDUFC1O43677 76 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 CCL13Q99616 98 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 Q9HAA7 133 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 LINC00315P59091 139 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 RMI2Q96E14 147 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
APOBEC4-201ENST00000308641 PLCE1Q9P212 2302 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms