RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXA5P20719 270 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-201ENST00000298838 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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PACSIN3-201ENST00000298838 ST20Q9HBF5 79 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TENM3Q9P273 2699 aa14.7□□□□□ -0.06
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PACSIN3-201ENST00000298838 FAM231CP0DMU5 169 aa14.68□□□□□ -0.06
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PACSIN3-201ENST00000298838 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.68□□□□□ -0.06
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PACSIN3-201ENST00000298838 Q8N8P6 123 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-201ENST00000298838 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0J9YWU9 116 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.66□□□□□ -0.06
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PACSIN3-201ENST00000298838 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf74Q32Q52 190 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01546A6NGU7 62 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACSIN3-201ENST00000298838 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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PACSIN3-201ENST00000298838 TCAPO15273 167 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-201ENST00000298838 GAGE1Q13065 139 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GAGE4Q13068 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GAGE5Q13069 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GAGE13Q4V321 117 aa14.57□□□□□ -0.08
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PACSIN3-201ENST00000298838 PAX4O43316 350 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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PACSIN3-201ENST00000298838 A0A096LNJ9 63 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 NUDT3O95989 172 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TSHBP01222 138 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.53□□□□□ -0.08
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