RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PET100P0DJ07 73 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB2AP61019 212 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 DNLZQ5SXM8 178 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 DERL1Q9BUN8 251 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9UF83 564 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 F5H697 171 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM17P0DL12 118 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SULT1A2P50226 295 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE6Q13070 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 EPDR1Q9UM22 224 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2L6O14933 153 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GUV1 79 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC160A6NGH7 325 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R036 132 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 MBP02144 154 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 IL15RAQ13261 267 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR4Q16378 134 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP10Q96PS8 301 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 LYRM1O43325 122 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf1O96002 111 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCJQ1A5X6 159 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM243Q9BU79 118 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT15Q9NV35 164 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRE2 83 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1G1O75348 118 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-ND6P03923 174 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 STAG3L2P0CL84 134 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 STAG3L3P0CL85 134 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 GCHFRP30047 84 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 BTCP35070 178 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB5CP51148 216 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2G1P62253 170 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR27Q6MZM9 219 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 DIRC1Q969H9 104 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPB11Q9Y547 144 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D1AO60880 128 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SLPIP03973 132 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 IL7P13232 177 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2D1P51668 147 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TSKUQ8WUA8 353 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC32Q9BV29 185 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A096LNI7 61 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX7O00628 323 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL12P30050 165 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 Q86TA4 180 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SUN5Q8TC36 379 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB24Q969Q5 203 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ISOC2Q96AB3 205 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 FMC1Q96HJ9 113 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1S3Q96PC3 154 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL1P09341 107 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SERF2P84101 59 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf56Q8N910 161 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD19Q96LW7 228 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-201ENST00000296642 LPAP08519 4548 aa4.84□□□□□ -1.63
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