RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF876PQ49A33 203 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 NACAE9PAV3 2078 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WWL8 130 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYGDP07320 174 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MRAP2Q96G30 205 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 TAX1BP3O14907 124 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 RASL10AQ92737 203 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE10A6NGK3 116 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MGPP08493 103 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT8Q8NBV8 401 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF415Q09FC8 603 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 IL17DQ8TAD2 202 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 ANK2Q01484 3957 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A096LNJ9 63 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R2P5 195 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01546A6NGU7 62 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM17P0DL12 118 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 FA2HQ7L5A8 372 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 PTH2Q96A98 100 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BUT2 72 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SPXQ9BT56 116 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP10-11P60412 298 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 Q8N8P6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 F5H697 171 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 M0QY20 66 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF56Q15929 161 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 MTURNQ8N3F0 131 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 C20orf78Q9BR46 151 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MWV9 139 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZSN1 163 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZTI0 123 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGEF1-201ENST00000284957 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 Q9UF83 564 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 RRN3P1Q2M238 152 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 X6R8D5 127 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 RS1O15537 224 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R17O96001 155 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 K7EMI3 77 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 HBDP02042 147 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 P0DMU3 169 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM231AP0DMU4 169 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM231CP0DMU5 169 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 NOTCH1P46531 2555 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 ST20Q9HBF5 79 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-201ENST00000284957 FCER1GP30273 86 aa6.68□□□□□ -1.34
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