RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640640.1

SCARB2-223, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-223	ENST00000640640	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	GAGE6	Q13070	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	LINC01545	Q5VT33	79 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	C2orf82	Q6UX34	121 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	NPS	P0C0P6	89 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	SIVA1	O15304	175 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	MLST8	Q9BVC4	326 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640		C9JAW5	83 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	EBI3	Q14213	229 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	CST9L	Q9H4G1	147 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	APOC4	P55056	127 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640		Q8N1Y9	231 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	TAL2	Q16559	108 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SCARB2-223	ENST00000640640	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.46	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640		A0A1B0GXF2	115 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	CEND1	Q8N111	149 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	PFN2	P35080	140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	IGF1	P05019	195 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	HERVK_113	P63121	156 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	ETDB	Q3ZM63	59 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640		K7ERJ3	54 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	IGHG4	P01861	327 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640		A0A096LPF7	62 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	SPINK8	P0C7L1	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640		Q6ZVH6	145 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640		A0A0J9YX75	114 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640		A0A1W2PPM0	123 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SCARB2-223	ENST00000640640	FGF6	P10767	208 aa		13.4	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	CDSN	Q15517	529 aa		13.4	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.4	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		K7EP34	96 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		K7EP13	123 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		A0A0J9YXV3	536 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	GAGE2E	Q4V326	116 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	YPEL4	Q96NS1	127 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		H3BMG7	143 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	NXPH4	O95158	308 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	MYCNOS	P40205	109 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		A0A0J9YY99	117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		F8W1H4	67 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640		Q8N6K4	173 aa		13.33	□□□□□ -0.27
SCARB2-223	ENST00000640640	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SCARB2-223	ENST00000640640	MTOR	P42345	2549 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SCARB2-223	ENST00000640640	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SCARB2-223	ENST00000640640	ODF1	Q14990	250 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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