RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	NF1	P21359	2839 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GVX0	72 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP5D1	E7EU14	171 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		H7BYZ3	331 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MSMB	P08118	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CXCL1	P09341	107 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFA4	P12838	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	GCHFR	P30047	84 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10J1	P30954	320 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FUT9	Q9Y231	359 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MTOR	P42345	2549 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF98	A6NK75	572 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		E7EUB6	86 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV1-47	P01700	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRGC2	P03986	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A8	P05109	93 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	NPPC	P23582	126 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5G3	P48201	142 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFA6	P56556	154 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R45	P59539	299 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	WT1-AS	Q06250	92 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF5	Q99942	180 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIVEP2	P31629	2446 aa		3.38	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CR1	P17927	2039 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HERVK_113	P63121	156 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IMMP2L	Q96T52	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PFDN5	Q99471	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf57	Q99622	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CUBN	O60494	3623 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PRE2	83 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LY6L	H3BQJ8	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CORT	O00230	105 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OR7C2	O60412	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BK	O60814	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHG2	P01859	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRGC1	P0CF51	173 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ORM2	P19652	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BO	P23527	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BB	P33778	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BD	P58876	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00313	P59037	77 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BC	P62807	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PLGLA	Q15195	96 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HCP5	Q6MZN7	132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	F8	P00451	2351 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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