RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280		A8MTW9	85 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DNM1-222	ENST00000636280	CACNG7	P62955	275 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DNM1-222	ENST00000636280	SAP30	O75446	220 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DNM1-222	ENST00000636280	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DNM1-222	ENST00000636280	EVI2A	P22794	236 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DNM1-222	ENST00000636280		K7ERU9	68 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	FXYD7	P58549	80 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PET117	Q6UWS5	81 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280		M0R381	172 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CKS2	P33552	79 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NCR2	O95944	276 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CD7	P09564	240 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53	7e-6	■■□□□ 12.5
DNM1-222	ENST00000636280	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NPY	P01303	97 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PF4	P02776	101 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280		Q8N1Y9	231 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	OR11H12	B2RN74	326 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	LINC01545	Q5VT33	79 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280		H0Y8G0	127 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	COX8A	P10176	69 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NXPH4	O95158	308 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MUC4	Q99102	2169 aa		11.71	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.71	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	GAGE10	A6NGK3	116 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SEC11A	P67812	179 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	FA2H	Q7L5A8	372 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	STH	Q8IWL8	128 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM238	C9JI98	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	HTN1	P15515	57 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	NRAC	Q8N912	160 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CITED1	Q99966	193 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	JPT2	Q9H910	190 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PRM2	P04554	102 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	C9orf118	A6NHY6	69 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280		H3BRM9	83 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280		G3V4G9	280 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	INS	P01308	110 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MGP	P08493	103 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DNM1-222	ENST00000636280	FGF6	P10767	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00315	P59091	139 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DNM1-222	ENST00000636280		A6NDN8	102 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DNM1-222	ENST00000636280	LINC01587	Q99440	93 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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