RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R2P5	195 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF138	P52744	262 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	C8orf88	P0DMB2	117 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A096LNJ9	63 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	HBD	P02042	147 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMB2	P49721	201 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	PROK1	P58294	105 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2D3	P61077	147 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2D2	P62837	147 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	UQCRQ	O14949	82 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLC6	P0CF74	106 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	HERVK_113	P63121	156 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	ASCL2	Q99929	193 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF492	Q9P255	531 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LETMD1-238	ENST00000623495	TG	P01266	2768 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS46	E5RG02	174 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV2-23	P01705	113 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV12-3	P01733	135 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYGD	P07320	174 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF137P	P52743	207 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	MLANA	Q16655	118 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM86B	Q8N661	226 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf32	Q32M92	178 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZQT7	251 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		5.52	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	NPY	P01303	97 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHG2	P01859	326 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5G1	P05496	136 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	SLURP1	P55000	103 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	PEX7	O00628	323 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N6K4	173 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		P01737	135 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	SYNJ2BP	P57105	145 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ODF3	Q96PU9	254 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	EPDR1	Q9UM22	224 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM89	A2RUT3	159 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKC	P01834	107 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	WT1-AS	Q06250	92 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	UPK2	O00526	184 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC61G	P60059	68 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	RIG	Q13278	110 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TWIST1	Q15672	202 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	DKK2	Q9UBU2	259 aa		5.5	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGV9	Q99603	122 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL24	O00175	119 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	DPM2	O94777	84 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA3	O95167	84 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	MAL	P21145	153 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53

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