RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01549A6NIU2 74 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCTAP57738 103 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM160Q9NX00 188 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BMM0 161 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H7C1H1 209 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VCYO14598 125 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MUC4Q99102 2169 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CBY3A6NI87 242 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCP2Q8IVA1 136 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERASQ7Z444 233 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIR2DL4Q99706 377 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F8VRH5 84 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEC11AP67812 179 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRYGDP07320 174 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSD52Q0P140 79 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF876PQ49A33 203 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTSCR1Q86UQ5 136 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ESM1Q9NQ30 184 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPSP0C0P6 89 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF56Q15929 161 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITPR3Q14573 2671 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCGB2A2Q13296 93 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAX2Q96IS3 184 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 M0QY20 66 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TAX1BP3O14907 124 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q6ZVH6 145 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAALCQ8WXS3 180 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FHL3Q13643 280 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIGD1BQ9P298 99 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCL24O00175 119 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A6NDN8 102 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF124Q15973 351 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JMJD8Q96S16 334 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AGRNO00468 2067 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD28P10747 220 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HTN1P15515 57 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM141Q96I45 108 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C16orf95Q9H693 158 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TENM4Q6N022 2769 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PRX2 142 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIPPLY3P57055 190 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF415Q09FC8 603 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2V1Q13404 147 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTTG1IPP53801 180 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGIPA6NJ69 53 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 M0R2P5 195 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RHOHQ15669 191 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VAMP3Q15836 100 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTH2Q96A98 100 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIMM17AQ99595 171 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INSP01308 110 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01006Q8NI28 216 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A8MWV9 139 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01587Q99440 93 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms