RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 A6NDN8 102 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 MGPP08493 103 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 EDN2P20800 178 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TFPI2P48307 235 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SLURP1P55000 103 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB1P60022 68 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 AMTNQ6UX39 209 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ERASQ7Z444 233 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 C18orf15Q96N68 181 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 FOXC2Q99958 501 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DKK2Q9UBU2 259 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE12BA1L429 117 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 F8VRH5 84 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 FXYD7P58549 80 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 UBE2V1Q13404 147 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM141Q96I45 108 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 KIR2DL4Q99706 377 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CSTL1Q9H114 145 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 H3BMM0 161 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TAX1BP3O14907 124 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 NMUP48645 174 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 RIPPLY3P57055 190 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 RHOHQ15669 191 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TAL2Q16559 108 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DUX5Q96PT3 197 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TIMM17AQ99595 171 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 USP17L23D6RBM5 183 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 H3BRM9 83 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 M0QY20 66 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CRYGDP07320 174 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF124Q15973 351 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZSV7 163 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 OR11H1Q8NG94 326 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 C16orf95Q9H693 158 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CHD6Q8TD26 2715 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 IGIPA6NJ69 53 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 A8MWV9 139 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 NPSP0C0P6 89 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB131AP59861 70 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 PCP2Q8IVA1 136 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 BAALCQ8WXS3 180 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 MDFICQ9P1T7 246 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CBY3A6NI87 242 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 OR11H12B2RN74 326 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 E9PLD3 99 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 J3QKU1 62 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 M0R2P5 195 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 RHODO00212 210 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 PRYO14603 147 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 PAX4O43316 350 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 CRYBA4P53673 196 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF415Q09FC8 603 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 PMVKQ15126 192 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 VAMP3Q15836 100 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF876PQ49A33 203 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-208ENST00000587914 OR11H2Q8NH07 326 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms