RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ID1P41134 155 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7ERJ3 54 aa18.02■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FABP2P12104 132 aa18.02■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEND1Q8N111 149 aa18.02■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LGALS9O00182 355 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRY2O43597 315 aa18■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa18■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASL10AQ92737 203 aa18■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLURP1P55000 103 aa18■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COTL1Q14019 142 aa18■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZSV7 163 aa18■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUBNO60494 3623 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLNP26678 52 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ESM1Q9NQ30 184 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV21A0A0B4J279 112 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF688P0C7X2 276 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM19A4Q96LR4 140 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 G3V4G9 280 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0R381 172 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD13Q5VXD3 122 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUX3Q96PT4 197 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F8VRH5 84 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOMM6Q96B49 74 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H7C1H1 209 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C20orf78Q9BR46 151 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FASNP49327 2511 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ORMDL2Q53FV1 153 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR11H1Q8NG94 326 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WFDC12Q8WWY7 111 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSTL1Q9H114 145 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPH3P1Q9H4G8 78 aa17.96■□□□□ 0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7EMI3 77 aa17.95■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAL2Q16559 108 aa17.95■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASIPP42127 132 aa17.95■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APRG1Q8IVJ8 170 aa17.95■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC01619G3V211 115 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C4orf3Q8WVX3 66 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGRNO00468 2067 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7EQG2 157 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MED14OSP0DP75 135 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 S100A4P26447 101 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCGB3A1Q96QR1 104 aa17.94■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NF1P21359 2839 aa17.93■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HECTD1Q9ULT8 2610 aa17.93■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa17.93■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa17.93■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 E9PLD3 99 aa17.92■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa17.91■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNRH2O43555 120 aa17.91■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf44Q8N8P7 122 aa17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTORP42345 2549 aa17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLL5B9A064 214 aa17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV3-20P01619 116 aa17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIPPLY3P57055 190 aa17.9■□□□□ 0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C12orf74Q32Q52 190 aa17.89■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POM121L12Q8N7R1 296 aa17.89■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAALCQ8WXS3 180 aa17.89■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MGPP08493 103 aa17.88■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2orf66Q6UXQ4 117 aa17.88■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC4Q99102 2169 aa17.88■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLLNB2CW77 178 aa17.88■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0J9YX75 114 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NXPH4O95158 308 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIST1H4GQ99525 98 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR11H12B2RN74 326 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR11H2Q8NH07 326 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PEMTQ9UBM1 199 aa17.87■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMR3AQ99954 134 aa17.86■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa17.86■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PRX2 142 aa17.86■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00315P59091 139 aa17.86■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SORL1Q92673 2214 aa17.85■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXI2Q6ZQN5 318 aa17.85■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF479Q96JC4 524 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GWB2 263 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRSS29PA6NIE9 313 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa17.83■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R17O96001 155 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD28P10747 220 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms