RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	IGIP	A6NJ69	53 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	HERVK_113	P61574	105 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	PMVK	Q15126	192 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WWL8	130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		G3V4G9	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SAP30	O75446	220 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF479	Q96JC4	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	JPT2	Q9H910	190 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GWB2	263 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CRYGD	P07320	174 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ELANE	P08246	267 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559		A6NJY4	79 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF815P	A8K554	130 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TSHB	P01222	138 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N1Y9	231 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	COX6B1	P14854	86 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559		F8W1H4	67 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf86	A6NJI1	115 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559		M0QY20	66 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TGFA	P01135	160 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	COTL1	Q14019	142 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RHOH	Q15669	191 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF56	Q15929	161 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559		A0A096LNT2	108 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	NRGN	Q92686	78 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RRN3-205	ENST00000563559	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559		Q6YL49	198 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ACACB	O00763	2458 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FSHB	P01225	129 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559		I3L3M4	83 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	EMP1	P54849	157 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559		H3BMG7	143 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2D1	P51668	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YY99	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559		J3QR89	54 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SORL1	Q92673	2214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559		J3QQQ9	107 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC2	Q14508	124 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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