RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.93□□□□□ -1.46
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SMAD3-211ENST00000559460 FGF7P21781 194 aa5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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SMAD3-211ENST00000559460 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.92□□□□□ -1.46
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SMAD3-211ENST00000559460 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 DIRC1Q969H9 104 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 JPT2Q9H910 190 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 GCGP01275 180 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 RAB5CP51148 216 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.9□□□□□ -1.46
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SMAD3-211ENST00000559460 RAB2AP61019 212 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 KHDC3LQ587J8 217 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf137Q5JT78 98 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 TVP23CQ96ET8 276 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 CDIP1Q9H305 208 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 NUDT15Q9NV35 164 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SULT1A1P50225 295 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R45P59539 299 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V1FQ16864 119 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SMUG1Q53HV7 270 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SUN5Q8TC36 379 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 H3BVH4 76 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SIX6O95475 246 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 TSPAN13O95857 204 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SULT1A2P50226 295 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF56Q15929 161 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 MITD1Q8WV92 249 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SGK494Q96LW2 274 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 IL36BQ9NZH7 164 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 M0R381 172 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 C15orf56Q8N910 161 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 DERL1Q9BUN8 251 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 MBD2Q9UBB5 411 aa5.85□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 H0Y9J4 135 aa5.84□□□□□ -1.47
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