RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RS1O15537 224 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 PPP1R17O96001 155 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 HLA-DQA1P01909 254 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 Q6ZTI0 123 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 GATD1Q8NB37 220 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 FAM210BQ96KR6 192 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 RETNQ9HD89 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 U3KQK5 164 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 A0A0J9YWU9 116 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 PPBPP02775 128 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 PRM2P04554 102 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 ATP5G1P05496 136 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 CAMPP49913 170 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 RAB4BP61018 213 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 DNHD1Q96M86 4753 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 GAGE12BA1L429 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 GAGE7O76087 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 GAGE12FP0CL80 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 GAGE12GP0CL81 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 GAGE12IP0CL82 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 DEFB130BP0DP73 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 DEFB130AP0DP74 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MRAP2Q96G30 205 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 YPEL4Q96NS1 127 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 F5H697 171 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 H3BNG1 76 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 DEFB4AO15263 64 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 IGHV3-53P01767 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 CRYGDP07320 174 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 RAB5AP20339 215 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 EVI2AP22794 236 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 SSTP61278 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 C12orf74Q32Q52 190 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 NACAE9PAV3 2078 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 COLCA2A8K830 154 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 PHOX2AO14813 284 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 APCSP02743 223 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 ZNF56Q15929 161 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 PRO0255Q9UI72 69 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 FBN3Q75N90 2809 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TENM3Q9P273 2699 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 A0A087WWL8 130 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MGPP08493 103 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 RAB4AP20338 218 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 CKS2P33552 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 RHOHQ15669 191 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 ORMDL3Q8N138 153 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 CELA1Q9UNI1 258 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 F5H768 121 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 TCAPO15273 167 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 SCO1O75880 301 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 LINC00315P59091 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 FHL2Q14192 279 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 AMN1Q8IY45 258 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 ZNF479Q96JC4 524 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 C20orf78Q9BR46 151 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 JPT2Q9H910 190 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 NIT2Q9NQR4 276 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-220ENST00000550700 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 K7EQD1 137 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 M0QY20 66 aa6.58□□□□□ -1.36
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