RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVFC1-1P60608 527 aa3.87□□□□□ -1.79
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CLSTN3-215ENST00000544584 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 LELP1Q5T871 98 aa3.87□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZNX1 250 aa3.87□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.87□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.87□□□□□ -1.79
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CLSTN3-215ENST00000544584 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.87□□□□□ -1.79
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CLSTN3-215ENST00000544584 M0R381 172 aa3.86□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 RTL8CO15255 209 aa3.86□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5AL1P0C617 328 aa3.86□□□□□ -1.79
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CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.85□□□□□ -1.79
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CLSTN3-215ENST00000544584 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.85□□□□□ -1.79
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf52Q96A22 123 aa3.85□□□□□ -1.79
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CLSTN3-215ENST00000544584 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.83□□□□□ -1.8
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CLSTN3-215ENST00000544584 CDK2AP2O75956 126 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 CRPP02741 224 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 CEBPGP53567 150 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TNP2Q05952 138 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 PEA15Q15121 130 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 C14orf177Q52M58 125 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 FRZBQ92765 325 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.81□□□□□ -1.8
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