RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 CRYGDP07320 174 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 EDN2P20800 178 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 PLNP26678 52 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 INSL3P51460 131 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ZNF415Q09FC8 603 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 MUC21Q5SSG8 566 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZN92 141 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ERASQ7Z444 233 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TMEM141Q96I45 108 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TIMM17AQ99595 171 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WX48 190 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 M0QY20 66 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TFPI2P48307 235 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SSTP61278 116 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ODF1Q14990 250 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DEFB136Q30KP8 78 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZQT7 251 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 KIR2DL4Q99706 377 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 HIGD1BQ9P298 99 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SORL1Q92673 2214 aa5.54□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 HIVEP2P31629 2446 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 OR11H12B2RN74 326 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 F8VRH5 84 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DPM2O94777 84 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 NUDT3O95989 172 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CD28P10747 220 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DEFB1P60022 68 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 PDZD2O15018 2839 aa5.53□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CENPEQ02224 2701 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CBY3A6NI87 242 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 J3KRW8 73 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 GAS8-AS1O95177 125 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 IGKCP01834 107 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 PRSS1P07477 247 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ZNF876PQ49A33 203 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 STHQ8IWL8 128 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 IL17DQ8TAD2 202 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CSTL1Q9H114 145 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 MDFICQ9P1T7 246 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ZANQ9Y493 2812 aa5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 VPS13CQ709C8 3753 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 IGIPA6NJ69 53 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 I3L3M4 83 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 EREGO14944 169 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RS1O15537 224 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 MGPP08493 103 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 FGF6P10767 208 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SEC11AP67812 179 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 GAGE1Q13065 139 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TAL2Q16559 108 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ATOH7Q8N100 152 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.51□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 hDV102S1A0JD36 115 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 KNCNA6PVL3 124 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms