RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 CXCL1P09341 107 aa9.68□□□□□ -0.86
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UBASH3B-202ENST00000525711 Q6ZTI0 123 aa9.68□□□□□ -0.86
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UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf85Q96MD7 179 aa9.68□□□□□ -0.86
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UBASH3B-202ENST00000525711 HAMPP81172 84 aa9.64□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.63□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF876PQ49A33 203 aa9.63□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 OR5AL1P0C617 328 aa9.62□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.62□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 CIDEAO60543 219 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLC6P0CF74 106 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 CT83Q5H943 113 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.61□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.6□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 PSCAO43653 123 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.6□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 FAM231BA6NCW3 169 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 A8MWV9 139 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 RS1O15537 224 aa9.59□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 ADIRFQ15847 76 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFP82Q8N141 532 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.59□□□□□ -0.87
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UBASH3B-202ENST00000525711 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.58□□□□□ -0.88
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UBASH3B-202ENST00000525711 SEC11CQ9BY50 192 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 SRIP30626 198 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 CACNG7P62955 275 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.57□□□□□ -0.88
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