RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 KIR2DL4Q99706 377 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SPTA1P02549 2419 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TCL1BO95988 128 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV1-69P01742 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHG2P01859 326 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CARD19Q96LW7 228 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 LGALS9O00182 355 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 FHL3Q13643 280 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TEN1Q86WV5 123 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRK-217ENST00000524534 PTH2Q96A98 100 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZFHX3Q15911 3703 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 A0A087WWL8 130 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CKS1BP61024 79 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CRYBA4P53673 196 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 F5H697 171 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 J3QQQ9 107 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 PF4V1P10720 104 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf85Q96MD7 179 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 SRD5A1P18405 259 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 ID1P41134 155 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 DCANP1Q8TF63 244 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 VCX2Q9H322 139 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 NBASA2RRP1 2371 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 A6NDX4 124 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 A8MWV9 139 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV1-40P01703 118 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 MT-ATP8P03928 68 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 SPINK8P0C7L1 97 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 LY6EQ16553 131 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZUT4 128 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM223A0PJW6 202 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 K7EMT4 169 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 M0QY20 66 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 LEPROTO15243 131 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 EDN2P20800 178 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 RHOHQ15669 191 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRK-217ENST00000524534 UCNP55089 124 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 XGP55808 180 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRK-217ENST00000524534 BLCAPP62952 87 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 ODF3Q96PU9 254 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 A4D1N5 150 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 M0QXV9 152 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4-39P01824 125 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 P0DMU3 169 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 FAM231AP0DMU4 169 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 FAM231CP0DMU5 169 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 MDFICQ9P1T7 246 aa8.54□□□□□ -1.04
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PTPRK-217ENST00000524534 H3BUX3 64 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-33P01772 117 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF688P0C7X2 276 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 CFHR3Q02985 330 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0B4J2C4 111 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-217ENST00000524534 TGFAP01135 160 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF56Q15929 161 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0J9YX75 114 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 RHODO00212 210 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 SLC25A20O43772 301 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 Q8N1Y9 231 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 RAX2Q96IS3 184 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ERG28Q9UKR5 140 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.5□□□□□ -1.05
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