RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 FOXI2Q6ZQN5 318 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PCP2Q8IVA1 136 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 Q8N8P6 123 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 AP1S3Q96PC3 154 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 KLK12Q9UKR0 248 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 HILPDAQ9Y5L2 63 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CFAP54Q96N23 3096 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CADP27708 2225 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.92□□□□□ -1.94
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SGCE-211ENST00000522045 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.92□□□□□ -1.94
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SGCE-211ENST00000522045 C11orf71Q6IPW1 123 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CEND1Q8N111 149 aa2.92□□□□□ -1.94
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF502Q8TBZ5 544 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MRAP2Q96G30 205 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TPPP3Q9BW30 176 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ONECUT1Q9UBC0 465 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PLCE1Q9P212 2302 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 A0A087WX48 190 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TMEM238C9JI98 176 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 F8VRH5 84 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 M0R381 172 aa2.91□□□□□ -1.94
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SGCE-211ENST00000522045 PLNP26678 52 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DMBP28068 263 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LEPP41159 167 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 KLRD1Q13241 179 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 APRG1Q8IVJ8 170 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 Q8N9W7 124 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.91□□□□□ -1.94
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SGCE-211ENST00000522045 C18orf15Q96N68 181 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FOXC2Q99958 501 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PRD5 423 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PRF3 423 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PRM7 423 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LINC01549A6NIU2 74 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 IGLL5B9A064 214 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 F8W1H4 67 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LYNX1G3V0Z9 82 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 K7ERJ3 54 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ORM1P02763 201 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRGV3P03979 118 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LYNX1P0DP58 116 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 RIPPLY3P57055 190 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 FXYD7P58549 80 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 LAGE3Q14657 143 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 RRN3P1Q2M238 152 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DL4Q99706 377 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 C20orf78Q9BR46 151 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SIRPDQ9H106 197 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 KNTC1P50748 2209 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 DMDP11532 3685 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 NCOR1O75376 2440 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 FAM223BA6NKX1 122 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 OR11H12B2RN74 326 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-211ENST00000522045 H7C1H1 209 aa2.89□□□□□ -1.95
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