RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 JPT2Q9H910 190 aa10.77□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 IL36BQ9NZH7 164 aa10.77□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 Q9UF83 564 aa10.77□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.76□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.76□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.76□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 KLK12Q9UKR0 248 aa10.76□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.76□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 A0A087WX48 190 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1W2PRE2 83 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 B4DEV8 164 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 H3BVH4 76 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 ELOBQ15370 118 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 NIT1Q86X76 327 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.75□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 BCL2L11O43521 198 aa10.74□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2WQ96B02 151 aa10.74□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.73□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.73□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.72□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 M0R036 132 aa10.72□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 PEX7O00628 323 aa10.72□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 TMUB2Q71RG4 321 aa10.72□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.72□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.72□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 A0A087WWL8 130 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2G2P60604 165 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 Q0VG73 95 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 DNLZQ5SXM8 178 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 Q86TA4 180 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
ITGA3-211ENST00000508100 M0R381 172 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 PFDN1O60925 122 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 C14orf177Q52M58 125 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 SFRP2Q96HF1 295 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 DNAH8Q96JB1 4490 aa10.7□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM262E9PQX1 116 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 SH2D1AO60880 128 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 OXTP01178 125 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 CRIP1P50238 77 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 STOML3Q8TAV4 291 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.69□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.68□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 ZFP82Q8N141 532 aa10.68□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.68□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 FAM74A7A6NL05 159 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV2-8P01709 118 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 CRPP02741 224 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2G1P62253 170 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF726P1Q15940 193 aa10.67□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2D3P61077 147 aa10.66□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2D2P62837 147 aa10.66□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.66□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 FMC1Q96HJ9 113 aa10.66□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.65□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 SLC51BQ86UW2 128 aa10.65□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.64□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.64□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 LINC01559Q495D7 138 aa10.64□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.64□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 UMAD1C9J7I0 102 aa10.63□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 ENHOQ6UWT2 76 aa10.63□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.63□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 HLA-DQA1P01909 254 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 RAB4BP61018 213 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 PKIAP61925 76 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF56Q15929 161 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 CST9LP1Q5W188 147 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.62□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms