RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.75□□□□□ -0.85
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RABGEF1-211ENST00000503687 RBAKDNA6NC62 111 aa9.75□□□□□ -0.85
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RABGEF1-211ENST00000503687 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N6K4 173 aa9.73□□□□□ -0.85
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RABGEF1-211ENST00000503687 C12orf74Q32Q52 190 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGEF1-211ENST00000503687 FAM231CP0DMU5 169 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGEF1-211ENST00000503687 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGEF1-211ENST00000503687 J3QQQ9 107 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGEF1-211ENST00000503687 U3KQK5 164 aa9.66□□□□□ -0.86
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