RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 TEX261Q6UWH6 196 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 PSG8Q9UQ74 426 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 SUN5Q8TC36 379 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PRE2 83 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 RBFOX3A6NFN3 312 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 GGTLC3B5MD39 225 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 IFNA1P01562 189 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 TCRAP04437 139 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 PRNTQ86SH4 94 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 PTH2Q96A98 100 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 PARLQ9H300 379 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 JPT2Q9H910 190 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00694P0DN24 101 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 TOR2AQ5JU69 321 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 K7EQM0 130 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 IGLV2-11P01706 119 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 SMUG1Q53HV7 270 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 MANBALQ9NQG1 85 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GV50 99 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 RAB14P61106 215 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 C5orf17Q8NAS9 161 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 SYT8Q8NBV8 401 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 TCEAL7Q9BRU2 100 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 A8MWV9 139 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 CST9LP1Q5W188 147 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 Q8N976 141 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 COX11Q9Y6N1 276 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2G2P60604 165 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00479Q96M42 142 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 KLK12Q9UKR0 248 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 EPDR1Q9UM22 224 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WWC5 75 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 FAM74A7A6NL05 159 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 RMI2Q96E14 147 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 GNG13Q9P2W3 67 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV34A0A0B4J273 112 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 PAGE4O60829 102 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 NIT1Q86X76 327 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 HIST1H2BAQ96A08 127 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2WQ96B02 151 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 OXTP01178 125 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 ASIPP42127 132 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 IGLV2-8P01709 118 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 LYPD6BQ8NI32 183 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRN-217ENST00000489650 H3BVH4 76 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 CCL20P78556 96 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 VAX2Q9UIW0 290 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 PDE6DO43924 150 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 S100A9P06702 114 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 BCL2P10415 239 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 IL36BQ9NZH7 164 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WWL8 130 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WX48 190 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 GRIFINA4D1Z8 144 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 B4DEV8 164 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 PEX7O00628 323 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 ARMS2P0C7Q2 107 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2G1P62253 170 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 M0R036 132 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 AKR1C3P42330 323 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 CRIP1P50238 77 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 FMC1Q96HJ9 113 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM262E9PQX1 116 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 RHODO00212 210 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 ELOBQ15370 118 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 CLLU1Q5K131 121 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms