RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YWU9 116 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 RS1O15537 224 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 SMIM17P0DL12 118 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 SLAQ13239 276 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZTI0 123 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GATD1Q8NB37 220 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GXF2 115 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GAGE12BA1L429 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GAGE7O76087 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GAGE12FP0CL80 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GAGE12GP0CL81 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GAGE12IP0CL82 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 ELOBQ15370 118 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 RYR1P21817 5038 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 DEFB4AO15263 64 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 MT-ND6P03923 174 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 ATP5G1P05496 136 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 DEFB130BP0DP73 79 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 DEFB130AP0DP74 79 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 CRYGDP07320 174 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 YPEL4Q96NS1 127 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DQA1P01909 254 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 RAB4BP61018 213 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 C12orf74Q32Q52 190 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 FAM210BQ96KR6 192 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 CELA1Q9UNI1 258 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 H7C1H1 209 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R17O96001 155 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 EVI2AP22794 236 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 CAMPP49913 170 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-211ENST00000488243 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 H3BNG1 76 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-53P01767 116 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 PPBPP02775 128 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SSTP61278 116 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 MRAP2Q96G30 205 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 ZNF479Q96JC4 524 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 JPT2Q9H910 190 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 PRO0255Q9UI72 69 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WWL8 130 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 LINC00315P59091 139 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 FHL2Q14192 279 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 MUC4Q99102 2169 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 COLCA2A8K830 154 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 F5H697 171 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 RAB4AP20338 218 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 RHOHQ15669 191 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 ZNF56Q15929 161 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 PHOX2AO14813 284 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 APCSP02743 223 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 MGPP08493 103 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZTC4 211 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 AMN1Q8IY45 258 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 F5H768 121 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 K7EQD1 137 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 SCO1O75880 301 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 RAB5AP20339 215 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 CRYBA4P53673 196 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-211ENST00000488243 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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