RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 BAALCQ8WXS3 180 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 Q9UF83 564 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRN-215ENST00000484986 IGLV2-8P01709 118 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRN-215ENST00000484986 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRN-215ENST00000484986 HMSDA8MTL9 139 aa14.41□□□□□ -0.1
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PTPRN-215ENST00000484986 ENHOQ6UWT2 76 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRN-215ENST00000484986 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.41□□□□□ -0.1
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PTPRN-215ENST00000484986 MPV17L2Q567V2 206 aa14.4□□□□□ -0.1
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PTPRN-215ENST00000484986 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRN-215ENST00000484986 A0A0D9SG52 128 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRN-215ENST00000484986 OXTP01178 125 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRN-215ENST00000484986 MIAQ16674 131 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRN-215ENST00000484986 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRN-215ENST00000484986 UMAD1C9J7I0 102 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRN-215ENST00000484986 F5H697 171 aa14.38□□□□□ -0.11
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