RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 PCP2Q8IVA1 136 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01549A6NIU2 74 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 Q8N6K4 173 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 CCL24O00175 119 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 K7EP34 96 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PPM0 123 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM262E9PQX1 116 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF876PQ49A33 203 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CFHR3Q02985 330 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ERG28Q9UKR5 140 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 H3BRM9 83 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 GTSF1Q8WW33 167 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 WFDC2Q14508 124 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF492Q9P255 531 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 DKK2Q9UBU2 259 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 INAFM1C9JVW0 142 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TNFRSF6BO95407 300 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 IGF1P05019 195 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB125Q8N687 156 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 COX8AP10176 69 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 C2orf82Q6UX34 121 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 H3BUA1 57 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 EDN2P20800 178 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6YL49 198 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV2-8P01709 118 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 C2orf70A6NJV1 201 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 TAX1BP3O14907 124 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB130BP0DP73 79 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB130AP0DP74 79 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CD28P10747 220 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.232e-8■■■□□ 16.4
PTPRVP-201ENST00000482597 CFAP161Q6P656 301 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 PIFOQ8TCI5 191 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 VWC2LB2RUY7 222 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHG4P01861 327 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 VCX2Q9H322 139 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CRYBA4P53673 196 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZSV7 163 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 NPYP01303 97 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 RBX1P62877 108 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 PPBPP02775 128 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 LAGE3Q14657 143 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CT83Q5H943 113 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRVP-201ENST00000482597 RASL11AQ6T310 242 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 SVIPQ8NHG7 77 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 HLA-DRB4P13762 266 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRVP-201ENST00000482597 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms