RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.62□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 DLC1Q96QB1 1528 aa-1.62□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.62□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC169A6NNP5 214 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 C5orf58C9J3I9 102 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 ATP5HO75947 161 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 APOC1P02654 83 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 IVLP07476 585 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 SLC25A4P12235 298 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 AP3S2P59780 193 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJB13P59910 316 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 HBBP68871 147 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 HRCT1Q6UXD1 115 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TEX29Q8N6K0 151 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 C10orf82Q8WW14 230 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TEX37Q96LM6 180 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 CARD19Q96LW7 228 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MPC1Q9Y5U8 109 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 RTL9Q8NET4 1388 aa-1.63□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MYH2Q9UKX2 1941 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 PIK3C2GO75747 1445 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1B0GV50 99 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 K7EP34 96 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TRGC2P03986 189 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 IFNA4P05014 189 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 CRYBA4P53673 196 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 UBE2D3P61077 147 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 PSME3P61289 254 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 UBE2D2P62837 147 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 OTOSQ8NHW6 89 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 SMIM7Q9BQ49 75 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 A0A087WUJ7 227 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 FABP12A6NFH5 140 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 M0QZ92 97 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 AIPO00170 330 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 TTRP02766 147 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 S100A3P33764 101 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 OMPP47874 163 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MAXP61244 160 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 BLCAPP62952 87 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MED21Q13503 144 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 OR8B8Q15620 311 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 PBDC1Q9BVG4 233 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 OTORQ9NRC9 128 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 C19orf12Q9NSK7 152 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 ERG28Q9UKR5 140 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.65□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-1.66□□□□□ -2.67
SHQ1-204ENST00000468347 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 KDM5CP41229 1560 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 ADCY9O60503 1353 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 ABCC11Q96J66 1382 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 PPP5D1E7EU14 171 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 MT1BP07438 61 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 SERPINA6P08185 405 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 CYBAP13498 195 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 MYL12AP19105 171 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 UBE2G2P60604 165 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 SPCS2Q15005 226 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 STK38Q15208 465 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 Q5VV11 94 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 BAGE3Q86Y29 109 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 IFT20Q8IY31 132 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 OR5H6Q8NGV6 325 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 BORCS8Q96FH0 119 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 PRELID3AQ96N28 172 aa-1.66□□□□□ -2.68
SHQ1-204ENST00000468347 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms